Cette étude montre qu’une part importante des mutations précédemment classées comme codantes dans le mélanome sont en réalité non codantes, en raison de l’utilisation de transcrits de référence non exprimés. Plus précisément, il a été constaté que les mutations situées dans la région promotrice commune des gènes IRF3 et BCL2L12 réduisaient l’expression de ces derniers, ce qui entraînait une baisse des taux de TP53 et une réponse moins favorable à l’immunothérapie.
Les mutations non codantes mal annotées dans les régions promotrices peuvent avoir des conséquences fonctionnelles, affectant l'expression génique et la réponse du patient au traitement ; cela souligne l'importance d'intégrer les données d'expression de l'ARN dans l'annotation des mutations.
Lignées cellulaires de mélanocytes humains Mel-ST modifiées par CRISPR-Cas9, présentant des mutations dans la région promotrice commune IRF3/BCL2L12, générées par genOway.
Mélanome, Mutations non codantes, Régulation génique, Réponse à l'immunothérapie, Génomique fonctionnelle
Édition génomique par CRISPR-Cas9, Ciblage de la région promotrice, Modification d'une lignée cellulaire de mélanocytes humains
De la conception du modèle aux résultats expérimentaux
Cité dans plus de 600 articles scientifiques
Collaboration avec 17 grands laboratoires pharmaceutiques,
plus de 170 entreprises biotechnologiques et plus de 380 établissements universitaires
Élaborées en collaboration avec des partenaires du secteur biopharmaceutique et en interne
et la garantie de la liberté d'exploitation
Modèles avec certificat sanitaire provenant d'éleveurs professionnels aux États-Unis et en Europe