構成的ノックアウト細胞株(従来型のノックアウト(KO)とも呼ばれる)とは、標的遺伝子が恒久的に不活性化されたモデルを指す。

タンパク質は生成されない。

用途

学術研究については:

  • その遺伝子および/またはタンパク質の主な機能を特定し、研究する
  • 遺伝子機能喪失に関する研究‍
  • ヒトの疾患のin vitroでの再現

バイオ医薬品の研究開発において:

  • in vitroでの標的検証
  • 創薬研究やスクリーニングのために、ヒトの疾患を再現する
  • 拮抗薬スクリーニング用の陽性対照
  • 合成致死性のスクリーニング
  • 創薬候補化合物の安全性、特異性、およびオフターゲット活性を検討する
  • バイオ生産モデルの性能向上

構成的ノックアウト細胞モデルの強み

  • すべてのアイソフォームを含むタンパク質の完全な欠如、または特定のアイソフォームの完全な欠如
  • 信頼性:各細胞株には、同系対照細胞クローンが対応付けられている
  • あらゆる遺伝的背景および細胞タイプにおいて適用可能

構成的ノックアウト細胞モデルの限界

  • KOタンパク質の機能は、関連するタンパク質によって補われる可能性があり、これを「遺伝的補償」と呼ぶ。
  • 対象遺伝子の遺伝子改変により、隣接する遺伝子の発現が乱され、非特異的な表現型が誘導される可能性がある
  • 多倍体度の高い細胞では困難である

→ 詳細なバイオインフォマティクス、遺伝学、および文献分析を行うことで、リスクを大幅に低減することができます
→ 別のモデルとして、
点変異 を導入して不活性なタンパク質を生成させる機能的ノックアウトである

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