組織特異的ノックアウトラットとは、対象となる遺伝子が「フロックス化」され、特定の組織内の特定の細胞型においてのみ不活性化される(コンディショナル)動物モデルを指す。その他の細胞型や組織では、改変されていない機能的な遺伝子発現が維持される。

この遺伝子の不活性化は、組織または細胞型特異的なCre-deleterラット系統を用いた追加の交配ステップによって達成される。このようなモデルの作製プロセスを通じて、全身(構成的)ノックアウトも実現可能となる。

用途

学術研究については:

  • 特定の臓器、組織、または細胞種における遺伝子の機能を研究する
  • 特定の細胞型における遺伝子不活性化によって引き起こされる病態を模倣する
  • 多機能タンパク質について、組織特異的な表現型を確立する

バイオ医薬品の研究開発において:

  • 細胞特異的な機能を持つ標的遺伝子の検証
  • 特定の細胞型におけるシグナル伝達経路を解明する
  • 安全性に関する研究

組織特異的ノックアウトラットモデルの強み

  • 非常に柔軟性が高く、別の組織の研究へ簡単に切り替え可能
  • このようなモデルから得られた科学的データの高い生理学的妥当性
  • 比較研究のために、構成型ノックアウトへのアクセスも可能にする

組織特異的ノックアウトラットモデルの限界

  • ラット系統の作製には、転写やスプライシングの制御を乱す可能性のある外因性配列(loxP、FRT)の挿入が必要となる
    → 詳細なバイオインフォマティクス、遺伝学、および文献解析を行うことで、リスクを大幅に低減することができる
  • デリーターラットはほとんど入手できないため、新しいCreデリーターラットの作製が必要となる
    → genOwayでは コンディショナル と並行して、新しい組織特異的または細胞特異的なCreラット系統を作製することができる
  • ある細胞型における対象遺伝子の不活性化は、細胞型の分化過程で生じることがあり、その結果、表現型の異常や細胞生理機能の変化をもたらすことがある
    → この制限は、次のような条件を適用することで回避できる 時間特異的な遺伝子不活性化
  • 組織特異性を得るためには、デレーター系ラットを用いた交配ステップが必要となり、これによりコホートの作成に多大な時間を要する
    → この「時間」の問題は、モデル開発に先立ち、科学的なコンサルティングの段階で予測し、考慮に入れておく必要がある
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