Un rat « knock-out » spécifique à un tissu désigne un modèle animal dans lequel un gène d'intérêt est « floxé » et peut donc être inactivé dans des types cellulaires spécifiques d'un certain tissu (de manière conditionnelle). Les autres types cellulaires et tissus présentent une expression génique fonctionnelle et non modifiée.

Cette inactivation génique est obtenue grâce à une étape de sélection supplémentaire avec une lignée de rats dotée d'un déleteur Cre spécifique à un type de tissu ou de cellule. Le processus de création de ces modèles permet également d'obtenir des modèles « knock-out »constitutifs(à l'échelle de l'organisme).

Applications

À des fins de recherche universitaire :

  • Étudier la fonction d'un gène dans un organe, un tissu ou un type de cellule spécifiques
  • Reproduire les pathologies causées par l'inactivation d'un gène dans un type cellulaire donné
  • Créer un phénotype spécifique à un tissu pour les protéines multifonctionnelles

Pour la recherche et le développement dans le domaine biopharmaceutique :

  • Valider les gènes cibles ayant des fonctions spécifiques à certaines cellules
  • Étudier les voies de signalisation dans certains types de cellules
  • Études de sécurité

Atouts des modèles de rats « knock-out » spécifiques à un tissu

  • Très polyvalent : permet de passer facilement à l'étude d'un autre tissu
  • Grande pertinence physiologique des données scientifiques obtenues à partir d'un tel modèle
  • Permet également d'accéder à des modèles « knock-out » constitutifs à des fins d'études comparatives

Limites des modèles de rats « knock-out » spécifiques à un tissu

  • La création d'une lignée de rats nécessite l'insertion de séquences exogènes (loxP, FRT) susceptibles de perturber la transcription et l'épissage
    → Ce risque peut être considérablement réduit grâce à une analyse approfondie sur les plans bioinformatique, génétique et bibliographique
  • Il existe peu de rats « deleter », ce qui nécessite la création de nouveaux rats « Cre-deleter »
    → De nouvelles lignées de rats « Cre » spécifiques à un tissu ou à une cellule peuvent être produites par genOway parallèlement au modèle conditionnel chez le rat
  • L'inactivation du gène d'intérêt dans un type cellulaire peut survenir au cours de la différenciation de ce type cellulaire, entraînant un phénotype altéré et/ou une physiologie cellulaire modifiée
    → Cette limitation peut être contournée en appliquant des conditions telles que l'inactivation génique à un moment précis
  • Pour obtenir une spécificité tissulaire, une étape de croisement avec une lignée de rats « deleter » implique une production fastidieuse de cohortes
    → Cette question du « temps » doit être anticipée et prise en compte dans le conseil scientifique préalable au développement du modèle
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